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本院於2014年正式成立兒童癌症跨部門多專科診療團隊，依據兒童癌症研究群(Taiwan Pediatric Oncology Group, TPOG) 與實證醫學，經團隊診療共識訂定治療指引，並定期舉辦團隊會議，對於新發病個案及異常事件進行研討並改進，以提供更正確、安全及有效率的診療品質。不僅是重視癌症兒童及家庭成員，提升病童與家屬關於兒癌疾病、營養與生長發育的護理與衛教知識，並連結多方資源，提供心理、家庭、社會的調適與學業上銜接，並適時導入緩和醫療，讓病童及家屬獲得身體心靈的整體性照護醫療。
網路掛號
| 科別 | 參考病症 | 依姓名筆畫排序 |
| 兒童血液腫瘤科 | 各種兒童血液腫瘤問題診療，兒童血液疾病、兒童癌症治療、兒童造血幹細胞移植、血癌、淋巴癌、貧血（缺鐵性貧血、地中海貧血）、血友病、小兒癌症免疫問題與細胞治療 | 杜佳叡、周書緯、周獻堂、林東燦、林凱信、張修豪、楊永立、盧孟佑 |
| 小兒外科 | 神經母細胞瘤及各類小兒惡性/良性腫瘤 | 林文熙、洪琬婷、許文明 |
| 兒童神經外科 | 小兒腦腫瘤、脊髓腫瘤之切除等各種兒童神經外科問題診療 | 周聖哲、郭夢菲、楊士弘 |
| 兒童營養諮詢 | 提供兒童營養諮詢自費門診，各類疾病飲食調養、營養評估、飲食設計與食物選擇和製備、營養品的選擇及兒童期之營養保健諮詢。 | 姜智礬 |