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高通量基因體暨巨量資料分析核心

核心位置

臺大醫院東址研究大樓二樓第二共同研究室(臺北市中正區中山南路七號)

 

核心簡介

隨著各類體學與高通量實驗技術的快速發展,高通量資料分析已成為生醫研究與臨床應用的重要工具。然而,龐大且複雜的數據資料,也常使研究人員在資料處理與解析上面臨挑戰。為提升本院高通量研究與資料分析能量,醫學研究部於2017年底,配合基因定序核心新增次世代定序相關服務,成立「高通量基因體暨巨量資料分析核心」。本核心提供各類高通量體學數據之生物資訊分析服務與教學,協助本院研究人員進行臨床與基礎研究所產生巨量資料的處理、分析、整合與解讀,以促進高通量技術於生醫研究與臨床應用之發展。服務內容涵蓋:

  • 實驗設計與諮詢
  • 次世代(短片段)定序資料分析 (包含WGS, WES, RNA-seq, miRNA-seq, ChiP-seq, CUT&Tag, ATAC-seq, Hi-C, TCR-seq等)
  • 長片段序列資料分析 (包含Nanopore與PacBio平台)
  • 微陣列數據 (Transcriptome, methylation, 與 SNP array)
  • 蛋白質體資料分析
  • 微菌相分析 (包含16s amplicon, metagenome, 與metatranscriptome)
  • 單細胞體學資料分析
  • 空間體學資料分析
  • 生物資訊流程客製化開發
  • 多組學資料整合與視覺化
  • AI與機器學習於生醫資料之應用

 

服務申請

申請人請點擊此連結(https://redcap.ntuh.gov.tw/surveys/?s=4MW9WDAWKM)透過RedCap填寫申請書,經評估後將安排會議討論細節。若需高通量實驗設計與生物資訊分析諮詢,請撥打院內分機#265989或寄信至chialanghsu@ntuh.gov.tw聯繫許家郎博士,毋需填寫申請表。

 

收費標準

分析費用按每小時五百元整計算,不足一小時以一小時計。此收費標準僅臺大醫院以及臺大醫學校區適用,臺大校總區收費為七百五十元整,其它單位則為一千五百元整。

 

線上分析資源
 
項目 資源介紹 預約連結
IPA Ingenuity Pathway Analysis TMS 課程編號 43891 預約連結(https://reg.ntuh.gov.tw/WebAppointment/Intro/WebWeek.aspx?InstNum=S211)
CLC Genomic Workbench TMS 課程編號 57533 預約連結(https://reg.ntuh.gov.tw/WebAppointment/Intro/WebWeek.aspx?InstNum=S020)

 

聯絡資訊
姓名 業務 院內分機
蔡承峰 先生 生物資訊分析  265768
邱鑑瑩 先生 生物資訊分析  265768
游文萱 博士 生物資訊分析  267297
張乃文 博士 生物資訊分析  261019
許家郎 博士 實驗設計及生物資訊分析諮詢  265989