國立臺灣大學醫學院附設醫院藥劑部組織架構: 藥劑部主任、 行政副主任、 教學副主任、 門診調劑組、 急診調劑組、 兒醫調劑組、 藥品諮詢組、 藥品管理組 (管理組之下設有臨床試驗用藥管理中心)、 化療調劑組、 無菌調劑組、 住院調劑組、 臨床藥事組。 另外設有三個委員會:藥事委員會、藥品行政管理委員會、管制藥品管理委員會。 以及國家級卓越臨床試驗中心藥學實驗室, 由本校教師兼任藥師。