一、醫療
依據衛生福利部認定之牙科專科及各專科學會認定之專科設定診療科別，如：家庭牙醫科/一般牙科、牙髓病科、牙體復形科、牙周病科、贗復補綴牙科、齒顎矯正科、兒童牙科、口腔顎面外科、口腔病理科/口腔診斷等九大專科，為病友提供最專業及完善之口腔醫療照顧。
除上述之九大專科外，同時也設有多個特別門診，如：特殊需求者牙科門診提供門診鎮靜麻醉或開刀房全身麻醉牙科治療、鎮靜麻醉特別門診、牙齒美白特別門診、顎顏面修復補綴特別門診、口腔黏膜特別門診、光動力治療特別門診、口腔檳榔嚼病特別門診、頭頸癌放射線治療口腔保健特別門診、顳顎關節障礙特別門診、牙科植體特別門診、AIDS醫療團隊等特殊醫療服務。並配合醫院睡眠中心，設立止鼾器製作服務門診。
本部為國內少數設有專屬獨立牙科病房之牙科部，目前計有合乎設施之標準病床23床(9間病房)，並有男、女醫師值班室、用膳室、總醫師室、護理長室、護理站、治療室(含3檯牙科治療椅)、觀察室、討論室、家屬文康聯誼室各一間。
設有獨立之牙科放射線室，並由3位專任領有放射線操作執照之放射線師操作及維護。
設有獨立之器械消毒準備及供應中心一間，可提供各種如高溫高壓或瓦斯消毒等滅菌流程，並由專人管理，並定期檢測各型機器。
二、教學
本部自民國84年起，獨立設有左述之九個專科分科，並為醫院正式公告之功能分科，各有專屬之科主任及主治醫師、住院醫師、實習醫師、見習醫師，並各有其獨立診間，且皆為專科醫師訓練機構，為國內少有之完整專科訓練場所。且本部九大分科主任均具有專科醫師及部定助理教授以上之資格。
本部各科皆訂有實習醫師、住院醫師教學計劃訓練手冊及實習醫師手冊，明訂有診療之標準作業流程及目標。
本部各功能分科均訂有住院醫師及實習醫師之訓練計畫，並由部主任及各分科主任擔任主持人。
牙科部網站具備網路教學及遠距醫療設備及功能，並提供各式學習課程。並具有部內專屬X光資訊傳輸系統及學生實習課程即時影像錄影傳輸系統。現正於網路建置所有牙科部課程之影音檔，以發展部內網路教學課程計劃。未來目標將建置具備牙科即時遠距網路教學及醫療會診功能。
每年會定期或不定期舉辦主辦或協辦多項科內或科外研討會，教學內容有助於住院醫師之學習，本部每年協辦學會、公會或協會之教學演講之舉行，平均約20-30次。
本部過去3年總醫師訓練期滿，參加專科醫師考試及格率為100%。
與國際多所大學牙醫學院建立姐妹校關係，每年有多項
學生交換學習、學術演講交流、短期教學及主治醫師進修計劃進行。
三、學術研究
本部與台大牙醫系所目前合計共擁有八個研究團隊，每年平均發表40-50篇SCI研究成果文章。並申請有科技部等研究計劃約20件。
- 口腔生醫及奈米科技研究團隊-主持人：林俊彬教授
本系所成員：鄭景暉教授、陳敏慧教授、李伯訓教授、陳羿貞副教授、章浩宏 副教授、賴向華助理教授、蔡宜玲主治醫師
跨領域合作成員：林峰輝教授、林啟萬教授、單秋成教授、鄭榮和教授、牟中原教授、陳振中副教授、謝國煌教授、陳兆勛教授、陳文斌教授、林弘萍副教授、艾啟峰兼任研究員
國際合作：Dr. Hickel（School of Dentistry, University of Munich, Germany), Dr. Song-Tao Shi and Dr. Chi-Kwan Chen（School of Dentistry, University of Southern California)
主要研究內容：主題一－牙本質過敏症機轉探討與治療材料之研發
主題二－牙髓手術修復術式之研究與奈米牙髓生物活性修復材料之研發
主題三－應用奈米薄層技術改善鎳鈦旋轉器械的表面性質與力學分析研究
- 癌症基因分子生物學研究團隊–主持人：郭彥彬教授
- 本系所成員：郭生興教授、林思洸教授、李正喆副教授、鄭世榮教授
- 免疫組織化學研究及光動力治療研究團隊–主持人：江俊斌教授
- 本系所成員：陳信銘助理教授、王逸平助理教授
- 牙科材料毒理學及分子生物學研究團隊–主持人：鄭景暉教授
- 本系所成員：李正喆副教授、張曉華助理教授、王姻麟講師、蔡宜玲主治醫師
- 跨領域合作成員：張美姬教授
- 口腔植體學研究團隊–主持人：林立德教授
- 本系所成員：王東美助理教授
- 跨領域合作成員：王兆麟副教授
- 顎咬合學及睡眠醫學研究團隊–主持人：陳韻之助理教授
- 本系所成員：王若松副教授、陳韻之助理教授
- 幹細胞及材料組織工程研究團隊–主持人：陳敏慧教授
- 本系所成員：姚宗珍副教授、陳羿貞副教授、章浩宏副教授、張瑞青副教授、賴向華助理教授
- 跨領域合作成員：游正博所長、郭宗甫院長、楊台鴻教授
- 齒顎矯正學臨床與基礎研究團隊–主持人：姚宗珍副教授
本系所成員：陳羿貞副教授、章浩宏副教授、張瑞青副教授、賴向華助理教授
跨領域合作成員：楊台鴻教授
主要研究內容：主題一－齒顎矯正用迷你植體之臨床應用研究
主題二－織與細胞受機械力量刺激之反應
主題三－數位化矯正測顱分析系統
主題四－幾何形態測量學之顱顏分析應用
四、硬體設備
本部擁有牙科界各種先進之治療儀器，包括電腦斷層攝影機、數位化牙科根尖、全口、側顱X光機、各式牙科雷射、根管及顯微手術用顯微鏡、3D全瓷冠電腦模擬製造機、頭頸部內視鏡、光纖照明頭燈、多功能臨床導航系統DentSim、臨床模擬系統、顯微教學系統等。此外，有如較精密高貴儀器如電腦斷層攝影機、3D全瓷冠電腦模擬製造機、多功能臨床導航系統DentSim等。
計有可容納100-200人之大型教室一間、容納50人之中型教室3間、容納10-20人之小型討論室或會議室9間，皆有足夠之視聽、筆記型電腦及投影機設備。
研究室有硬組織研究室、顱面成長發育研究室、牙周病學研究室、口腔病理學研究室、口腔組織學研究室、材料科學研究室、咬合生理學研究室、牙髓病學研究室、分子生物學研究室、口腔生物學研究室、口腔微生物研究室、免疫研究室、雷射研究室等。