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次世代定序變異判讀

送檢流程與注意事項:
  • 以下所有檢驗項目送檢時都需填寫基因醫學部高通量定序檢驗室_委託送檢單(連結) 
  • 以下所有檢驗項目僅收本院檢體
  • 開下列醫令後務必通知基因醫學部 (02)2312-3456 #274259/#271930吳小姐/胡小姐,以便進行後續作業
  • 報告時間: 4-12週 (收件時間以收到定序檔案起算)
  • 檔案類型:FASTQ檔 
    • 如定序檔案不符內部品管標準,將退件
      • WES
        • 每個樣本定序通量資料量:≧3.5G
        • 每個樣本Bam檔平均讀深:≧100X
      • WGS
        • 每個樣本Bam檔平均讀深:≧30X
        • 每個樣本定序通量資料量:≧45G
      • 通過FASTQC-Per Base Sequence Quality: very good quality calls (green)
    • 收到定序檔案時間延遲或退件後再補件,將導致發報告時間延後請提醒醫師與病患注意回診時間
    • 須提供定序的Kit(實驗試劑套組)名稱;如無提供,後續分析可能不完整
  • 檔案提供方式

    • USB/硬碟(進行分析後USB/硬碟實驗室自行銷毀,不寄回):
      1. 送檢醫師或其醫療團隊人員交給基因醫學部吳小姐/胡小姐
      2. 寄送 (務必包裹,如檔案毀損或不符合,將退件)
        • 寄件地址:(10041)台北市中正區中山南路8號台大醫院 基因醫學部 兒童醫院大樓19樓19028室
    • 雲端:
      • 請先致電(02)2312-3456 #274259/#271930吳小姐/胡小姐,以便進行後續作業。

         


聯絡人: 吳慧璿小姐  電話:(02)23123456 ext 274259

編號 醫令碼 項目 檔案類型 收費 報告時間
1 000X0256

目標基因次世代定序變異判讀-遺傳性疾病基礎分析

Targeted NGS variant interpretation – basic genetic disease analysis

FASTQ 3,000 4週-12週
2 000X0257

全外顯子次世代定序變異判讀-遺傳性疾病基礎分析

Whole exome NGS variant interpretation – basic genetic disease analysis 

FASTQ 5,000 4週-12週
3 000X0258

全基因體次世代定序追加判讀-體藥物基因體學、HLA基因型、及多基因危險性分析

Whole genome NGS additional interpretation – pharmacogenomics, HLA, polygenic risk analyses 

FASTQ 15,000 4週-12週