1 目的：正確的檢體採集能夠提升檢驗結果之準確性，建立糞便檢體標準作業程序，能夠提供醫檢師快速、準確的檢驗，進而提升整體之檢驗品質。
2 採檢前作業流程
2.1 每一項檢驗醫令必需由臨床醫師開立，同時必須正確且完整的記錄於電子資訊系統與紙本之病歷。
2.2 每一項檢驗申請內容，應包含完整之受檢者姓名，出生日期，檢體採集日期與時間，檢驗醫令開立之醫師姓名。若有特殊事項，應一併註記於申請內容。
2.3 正確辨識受檢者，包含姓名與出生日期。
2.4 正確辨識檢驗申請內容，包含檢驗項目，檢體類別，確認檢驗申請之效期。
2.5 依據條碼標籤準備對應之檢驗容器，選擇適當之容器收集糞便檢體。例如：
2.5.1 糞便潛血化學法為58號T型糞便管
2.5.2 糞便潛血免疫定量法為iFOBT專用14號OB(IA) 採便管
2.5.3 糞便一般細菌與黴菌常規培養為含培養基之10號糞便培養採集管
2.5.4 分枝桿菌、C. difficile toxin test及寄生蟲為59號無菌罐(無菌容器)
2.5.5 病毒糞便檢查為28號附挖杓無菌盒。
3 糞便採檢作業流程
3.1 依檢驗申請內容對受檢者進行口頭採檢衛教說明，必要時可提供紙本說明。並請受檢者確認採檢容器已貼上受檢者之姓名與出生日期。
3.2 受檢者自行採集糞便檢體之流程：
3.2.1 受檢者必需注意，不可將尿液解入便盆。如有必要時，可於便盆鋪設無含螢光劑之紙巾方便收集檢體。
3.2.2 受檢者依檢驗申請內容，衛教內容或衛教單張說明，以適當工具採取適當量之糞便檢體，並將糞便檢體裝入該對應之檢驗容器。
(1)用於糞便潛血檢查，以58號T型糞便管採檢，只要採集約花生米粒大的糞便即可；若為液狀便，則倒入1－2 mL。
(2)若有糞便寄生蟲卵、阿米巴檢查(直接抹片檢查) ，以 58 號 T 型糞便管採檢，要採集約拇指大(約 1g)的糞便即可；若為液狀便，則倒入 2 -3 mL。
3.3 採檢者協助受檢者採集糞便檢體之流程:採檢者必需先以肥皂清洗雙手，以已滅菌之紙巾擦乾雙手。採檢者必須穿戴採檢手套以協助採檢。
3.3.1 採檢者執行肛門指診後，手套上的糞便，可使用於糞便潛血檢查。糞便潛血化學法，必須將手套上的糞便，以58號T型糞便管內附之採檢棒收集。糞便潛血免疫定量法則使用iFOBT專用14號OB(IA)採便管內附之採檢棒收集。
3.3.2 對於嬰幼兒採便，如有採集檢體的困難，通常可用塑膠製不易破裂之中空管，以清水濕潤管壁後插入肛門，應可順利採集檢體，再將糞便裝入檢驗容器送驗。
4 糞便潛血化學法(58 號 T 型糞便管) 檢體採集與注意事項：
5 糞便潛血免疫定量法(iFOBT專用14號OB(IA)採便管)，檢體採集與注意事項：
5.1 因為糞便中的血液分布不均糞便通病變部位時，血液多附著於糞便的表面，因此，在採便取樣時，請在糞便表面的不同地方量擦過多次取樣。
5.2 有關採便取樣時之採便量，建議只要採集能蓋滿採便棒的溝槽之少許量即可。
5.3 採便取樣後，採便棒一次插入採便管中即可取檢驗所需的糞便量，不可重複多次插入採便管。
5.4 採便取樣後採便管，建議於採檢當天立即送至檢驗單位，若無法立即送至檢驗單位，請將採便取樣後之採便管先放於陰涼處，並速送回檢驗單位檢驗。
5 糞便細菌培養檢體採集與注意事項：
5.1 一般細菌與黴菌常規培養：使用糞便細菌培養採集管（如下圖）
採集方法：
| 圖示 |
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| 步驟 | 撕開包裝，取出檢體採集棉棒 | 以棉棒沾取有粘液、膿、血液或組織碎片的部分為佳 | 將容器上蓋打開，放入棉棒 | 將棉棒折斷（斷點為紅點處） | 蓋回上蓋，將檢體混合均勻 |
5.2 C. difficile toxin test之檢查以及分枝桿菌和寄生蟲之培養與鑑定
5.2.1 容器：59號無菌罐(無菌容器)
5.2.2 步驟：
(1)病人排便於清洗過的便器，不可與尿一起排泄。
(2)選取有粘液、膿、血液或組織碎片的部分，以木棒或容器內塑膠片，挑取約拇指大之大便，放於上述容器內。
5.3 注意事項：
5.3.1 糞便檢體亦可由直腸直接採集。
5.3.2 糞便檢體若無法立刻送檢時，必須放在4℃冰箱，24小時內送檢。
5.3.3 建議每位病人勿送檢超過2次的糞便檢體，除非有臨床特殊需求。
5.3.4 建議病患住院超過三天以上，不須執行常規糞便培養，除非有臨床特殊需求。
5.3.5 病患年紀超過6個月以上，若有明顯腹瀉情況及抗生素暴露史，建議以C. difficile 培養與C. difficile toxin test代替常規糞便培養。
6 糞便病毒抗原檢驗之檢體
6.1 採檢容器：28號附挖杓無菌盒 
6.2 糞便抗原檢測(Rotavirus、Adenovirus 40/41)直接取至少1g stool放入病毒抗原檢測用糞便採集罐- 28號附挖杓無菌盒中（請勿放在病毒採檢套組(120)中）。