本院整合各科部醫療團隊，成立了：

　　兒童發展評估及療育中心、成人期先天性心臟病、唐氏症整合門診、結節硬化症整合門診、兒少保護醫療服務示範中心、兒童內視鏡微創手術團隊、兒童腦血管毛毛樣病團隊、神經母細胞瘤手術及醫療研究特別團隊、新生兒及早產兒手術醫療團隊、兒童頑固型癲癇症治療團隊、兒童環境醫學、高危險群新生兒後送中心、馬凡氏症整合門診、兒童神經肌肉疾病聯合照護門診、兒童友善醫療服務、兒童安寧緩和醫療、雷特氏症聯合照護門診及兒童顱顏醫療團隊等，期望能為本院病童及家屬帶來更友善且優質的醫療

• ​兒童發展評估及療育中心
• 成人期先天性心臟病​
• 唐氏症整合門診​
• ​節結硬化症整合門診
• ​兒少保護醫療中心
• ​兒童內視鏡微創手術團隊
• ​兒童腦血管毛毛樣病團隊
• 神經母細胞瘤手術及醫療研究特別團隊​
• 新生兒及早產兒手術醫療團隊​
• ​兒童頑固型癲癇症治療團隊
• ​兒童環境醫學
• ​高危險群新生兒後送中心
• ​馬凡氏症整合門診
• 兒童神經肌肉疾病聯合照護門診​
• 兒童友善醫療服務​
• ​兒童安寧緩和醫療
• ​雷特氏症聯合照護門診
• ​兒童顱顏醫療團隊