病理學為臨床醫學的基礎，也是醫學研究中極為重要的一門學問。臺大醫學院病理學科的前身是台北帝國大學醫學部病理學教室，於1936年及1937年分別開設病理學第一及第二講堂，位置在舊址「綜合研究館」（目前醫學院二號館附近）。1954年，在附設醫院設立「病理科」，與病理學科及研究所成為一綜合基礎與臨床教學服務的特殊學科，研究得以拓展。1994年病理科改編為病理部，並依功能分設各科：解剖病理科、法醫病理科、分子病理科、細胞病理科及遺傳病理科。2000年將功能分科改為外科病理科、解剖及法醫病理科、細胞病理科及分子病理科，2008年正式成立四個分科:外科病理科、解剖及法醫病理科、細胞病理科及分子病理科。2010年解剖及法醫病理科更名為大體解剖病理科。

1. 病理組織切片檢查
2. 冷凍切片檢查
3. 組織化學染色
4. 免疫組織化學染色
5. 免疫螢光染色
6. 婦科細胞學
7. 細胞蠟塊
8. 電子顯微鏡
9. 病理解剖
10. 分子病理學
11. 血液病染色體
12. 人體生物組織庫

1. 本部提供完整的解剖病理專科醫師訓練計劃。住院醫師在訓練前四個月由各次專科醫師指導，以對各次專科有基本認識。第一、二年輪做外科檢體及病理解剖的病例，第二年下半年及第三年輪流接受腎臟病理、血液病理、細胞病理等各次專科訓練一至三個月。第四年輪流接受細胞病理及分子病理訓練。每週有多種討論會訓練所有的住院醫師，包括：次專科教學、臨床病理討論會、解剖病例討論會及期刊討論會、多科診療團隊會議等。
2. 本部自110學年度起與法醫學研究所合作 開辦解剖病理及法醫病理雙專科訓練計劃。在五年的訓練時程中，完成解剖病理專科醫師訓練，法醫學碩士及報考法醫師之資格，為國家培養兼具解剖病理及法醫病理專長的人才。
3. 對醫學系、牙醫學系四年級學生、護理系二年級、醫技系三年級、藥學系四年級以及公衛、復建、職能治療等各系之三年級同學的病理科課程及實習，由全體病理部教員及主治醫師負責擔任指導及上課。
4. 本科部另設有病理研究所，招收博士班及碩士班學生。碩士班加設病理檢驗組，培養病理檢驗技術人才。

1. 本部進行各種疾病的研究工作，特別著重於本地常見的癌症如肝癌、肺癌、大腸癌之分子病理研究。
2. 罕見腫瘤的基因及臨床特徵。
3. 疾病的動物模式的建立。
4. 腫瘤診斷，預後及預測治療工具之開發。
5. 非腫瘤疾病的研究。

1. 本部醫師在軟組織腫瘤、肺癌、膽管癌、大腸癌、頭頸部腫瘤等多項研究受國際重視，本部多位醫師為WHO腫瘤分類專書的章節作者，並有多項研究為WHO腫瘤分類專書所引用。
2. 設立分子病理實驗室協助惡性腫瘤的基因診斷。分子病理實驗室利用各種先進分生方法來診斷疾病。例如：診斷腫瘤基因突變及染色體轉位，這些結果得以和傳統形態診斷及免疫組織化學染色結果整合，幫助病理診斷及指引精準醫療。本部分子病理實驗室並建立了外送醫令，使本院腫瘤病人得以接受次世代定序檢驗，有利於找出治療標的。
3. 本部於108年建立解剖病理及法醫病理雙專科訓練制度。
4. 本部自109年2月起啟用Cerebro 檢體處理及追蹤系統，以監控檢體處理的流程，降低錯誤發生。
5. 本部於109年7月通過全國認證基金會 ISO15189 醫學實驗室認證。
6. 自110年8月起啟用數位玻片系統並開始引進人工智慧輔助程式協助進行病理診斷。

1. 服務方面：

          (1)強化次專科制度，並以教育訓練讓本部醫師了解病理學最新進展，以提昇病理報告的準確性。

          (2)發展人工智慧轉助病理程式，以增進病理診斷的效率及一致性。

          (3)在本院內建立腫瘤次世代定序檢驗的醫令。

          (4)與法醫學科合作，培養法醫病理專才及建立影像解剖實驗室。

2. 研究及教學方面：

          本部未來的研究發展重點如下：

          (1)疾病的形態學，基因變化及臨床研究。

          (2)疾病的分子機轉。

          (3)疾病的小鼠模式。

          (4)腫瘤免疫研究。

          (5)以人工智慧發展病理診斷工具。

3. 提升以病例為中心的教學活動，和其他國內外病理機構進行學術交流，提昇本部討論風氣和學術氛圍。

           財團法人全國認證基金會認證證書

           CAP證書